O gasoduto Bolívia-Brasil interage com cinco estados, 137 municípios, seis entidades governamentais de Meio Ambiente (Ibama e Secretarias Estaduais de Meio Ambiente), instituições financeiras multilaterais e dezenas de outras organizações governamentais e não governamentais.

O processo de licenciamento ambiental do gasoduto teve seu início em 1992. Cinco anos depois, com o avanço das negociações entre as organizações e as entidades financeiras, foi elaborado o Estudo de Impacto Ambiental Consolidado para antender às exigências estabelecidas nas diretrizes ambientais dos bancos financiadores. Neste mesmo ano foi obtida a licença de instalação para o início das obras. Após a execução das obras em conformidade com a legislação ambiental, foram concedidas as licenças de operação de todo o gasoduto.

Profissionais da ENGEMA fizeram a inspeção ambiental das atividades construtivas do trecho Guararema-Paulínia, com um total de área inspecionada de mais de 5.000.000 m2. Todas as fases da obra foram acompanhadas, desde a limpeza do terreno e abertura de valas, até a completa recuperação do terreno, com recuperação topográfica, hidrosemeadura da superfície e reconstituição das margens de rios e córregos. Foram realizadas auditorias constantes, com reuniões pró ativas com os agentes participantes da obra, que contribuíram para o reconhecimento internacional de empreendimento ambientalmente correto.